GATE

Descrição

GATE (Grid Analysis of Time-Series Expression) é uma plataforma de software computacional integrada para a análise e visualização de séries temporais biomoleculares de alta dimensão. O GATE usa um algoritmo de agrupamento baseado em correlação para organizar séries temporais moleculares em uma matriz hexagonal bidimensional e colore dinamicamente hexágonos individuais de acordo com o nível de expressão do componente molecular ao qual eles são atribuídos, para criar filmes animados de níveis moleculares de sistemas. dinâmica regulatória. A fim de inferir potenciais mecanismos de controle regulatório a partir de padrões de correlação, o GATE também permite a interrogação interativa de filmes contra uma ampla variedade de conjuntos de dados de conhecimento prévio. Os filmes GATE podem ser pausados ​​e são interativos, permitindo aos usuários reconstruir redes e realizar análises de enriquecimento funcional. Filmes criados com GATE podem ser salvos em formato Flash e inseridos diretamente em arquivos manuscritos PDF como figuras interativas.