POY

Descrição

POY é um programa de análise filogenética que suporta vários tipos de dados (por exemplo, morfologia, nucleotídeos, genes e regiões de genes, cromossomos e genomas inteiros). POY é particular, pois pode realizar alinhamento verdadeiro e inferência de filogenia, ou seja, as sequências de entrada não precisam ser pré-alinhadas. Inserções, exclusões e rearranjos podem ser incluídos na pontuação geral da árvore em Máxima Parcimônia ou no modelo em Máxima Probabilidade. Uma variedade de algoritmos heurísticos foram desenvolvidos para este propósito e são implementados em POY.